自転車の売買に自転車譲渡証明書を渡すのですが、個人情報があり心配です。購入する人も2段階認証等で身元が分かる様になっているのですか？初めての利用なので心配です。
自転車売買で自転車譲渡証明書がいる事を知らなかったので…

自転車をフリマで第三者に譲渡する際、匿名での取引は不可能です。
これはジモティ以外もそうです。

最終的に書類を渡すのが嫌なら、双方記入した上で一緒に登録所まで行く。登録の切り替えが終わったら書類を返してもらう。
などすればよいかと。
（登録後、書類は不要になります。けいさつや自転車屋などに渡しません）

相手に身元がばれるのが嫌なら、身近な信頼できる人に譲渡するしかありません。

これはジモティに限った問題ではないので、グーグル検索したらいろいろ出てくるので調べてみては。